Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms