Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms