Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D1

Rnf225, RING finger protein 225, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf225Q9D7D1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Gm11834-201ENSMUST00000122257 585 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Il22-201ENSMUST00000096691 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Vmn1r224-201ENSMUST00000170076 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Gm20854-202ENSMUST00000181549 1156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Gm20812-202ENSMUST00000189550 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 4930442G15Rik-201ENSMUST00000213112 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 AC147628.1-201ENSMUST00000228193 688 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf225Q9D7D1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms