Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms