Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc81Q9D5W4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms