Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Ubxn11Q9D572 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Ubxn11Q9D572 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Ubxn11Q9D572 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Ubxn11Q9D572 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Ubxn11Q9D572 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Ubxn11Q9D572 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Ubxn11Q9D572 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Ubxn11Q9D572 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Ubxn11Q9D572 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Ubxn11Q9D572 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Ubxn11Q9D572 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Ubxn11Q9D572 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Ubxn11Q9D572 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms