Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms