Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D454 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D454 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D454 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D454 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D454 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D454 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D454 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D454 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D454 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D454 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D454 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D454 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D454 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D454 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D454 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D454 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D454 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D454 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D454 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D454 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D454 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D454 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D454 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D454 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D454 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D454 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D454 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D454 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D454 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D454 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D454 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D454 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D454 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D454 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D454 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D454 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D454 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D454 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D454 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D454 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D454 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D454 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D454 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D454 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D454 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D454 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D454 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D454 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D454 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D454 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D454 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D454 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D454 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D454 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D454 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D454 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D454 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D454 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D454 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D454 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D454 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D454 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D454 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D454 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D454 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D454 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D454 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D454 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D454 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D454 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D454 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D454 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D454 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D454 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D454 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D454 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D454 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D454 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D454 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D454 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D454 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D454 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D454 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D454 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D454 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D454 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D454 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D454 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D454 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D454 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D454 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D454 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D454 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D454 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D454 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D454 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D454 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D454 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D454 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms