Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms