Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms