Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms