Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Susd3Q9D176 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd3Q9D176 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Susd3Q9D176 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd3Q9D176 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Susd3Q9D176 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Susd3Q9D176 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Susd3Q9D176 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Susd3Q9D176 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Susd3Q9D176 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Susd3Q9D176 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Susd3Q9D176 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Susd3Q9D176 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Susd3Q9D176 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd3Q9D176 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd3Q9D176 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd3Q9D176 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd3Q9D176 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd3Q9D176 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd3Q9D176 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd3Q9D176 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd3Q9D176 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd3Q9D176 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd3Q9D176 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd3Q9D176 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd3Q9D176 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd3Q9D176 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd3Q9D176 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd3Q9D176 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd3Q9D176 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd3Q9D176 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd3Q9D176 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd3Q9D176 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd3Q9D176 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd3Q9D176 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd3Q9D176 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd3Q9D176 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd3Q9D176 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd3Q9D176 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd3Q9D176 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd3Q9D176 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd3Q9D176 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd3Q9D176 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms