Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Sgo1Q9CXH7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Sgo1Q9CXH7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Sgo1Q9CXH7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Sgo1Q9CXH7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Sgo1Q9CXH7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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