Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Xrcc3Q9CXE6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Xrcc3Q9CXE6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Xrcc3Q9CXE6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Xrcc3Q9CXE6 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Xrcc3Q9CXE6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Xrcc3Q9CXE6 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Xrcc3Q9CXE6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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