Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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