Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms