Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Tmed6Q9CQG0 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed6Q9CQG0 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms