Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQC3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQC3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQC3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQC3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQC3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQC3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQC3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQC3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQC3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQC3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQC3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQC3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms