Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ubl4bQ9CQ84 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubl4bQ9CQ84 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubl4bQ9CQ84 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubl4bQ9CQ84 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubl4bQ9CQ84 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubl4bQ9CQ84 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubl4bQ9CQ84 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubl4bQ9CQ84 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubl4bQ9CQ84 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubl4bQ9CQ84 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubl4bQ9CQ84 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubl4bQ9CQ84 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubl4bQ9CQ84 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubl4bQ9CQ84 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubl4bQ9CQ84 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubl4bQ9CQ84 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubl4bQ9CQ84 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubl4bQ9CQ84 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubl4bQ9CQ84 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubl4bQ9CQ84 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubl4bQ9CQ84 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubl4bQ9CQ84 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubl4bQ9CQ84 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubl4bQ9CQ84 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubl4bQ9CQ84 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubl4bQ9CQ84 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubl4bQ9CQ84 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubl4bQ9CQ84 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubl4bQ9CQ84 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubl4bQ9CQ84 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms