Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms