Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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