Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms