Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bhlhe41Q99PV5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms