Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atoh8Q99NA2 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms