Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd1Q99MV1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd1Q99MV1 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms