Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB1

Tlr3, Toll-like receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr3Q99MB1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Tlr3Q99MB1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Tlr3Q99MB1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Tlr3Q99MB1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Tlr3Q99MB1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Tlr3Q99MB1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Tlr3Q99MB1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Tlr3Q99MB1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tlr3Q99MB1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tlr3Q99MB1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tlr3Q99MB1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tlr3Q99MB1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tlr3Q99MB1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tlr3Q99MB1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tlr3Q99MB1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms