Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprtQ99M80 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms