Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pacsin3Q99JB8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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