Protein–RNA interactions for Protein: Q924Y0

Bbox1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbox1Q924Y0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bbox1Q924Y0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bbox1Q924Y0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bbox1Q924Y0 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bbox1Q924Y0 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bbox1Q924Y0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bbox1Q924Y0 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bbox1Q924Y0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bbox1Q924Y0 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bbox1Q924Y0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bbox1Q924Y0 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bbox1Q924Y0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bbox1Q924Y0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bbox1Q924Y0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bbox1Q924Y0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bbox1Q924Y0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bbox1Q924Y0 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bbox1Q924Y0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bbox1Q924Y0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bbox1Q924Y0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bbox1Q924Y0 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bbox1Q924Y0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bbox1Q924Y0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bbox1Q924Y0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bbox1Q924Y0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bbox1Q924Y0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bbox1Q924Y0 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bbox1Q924Y0 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms