Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Clip1Q922J3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms