Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms