Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Slc6a20aQ8VDB9 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Slc6a20aQ8VDB9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Slc6a20aQ8VDB9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Slc6a20aQ8VDB9 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Slc6a20aQ8VDB9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Slc6a20aQ8VDB9 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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