Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms