Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hecw1Q8K4P8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hecw1Q8K4P8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hecw1Q8K4P8 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hecw1Q8K4P8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hecw1Q8K4P8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms