Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ssh3Q8K330 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssh3Q8K330 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ssh3Q8K330 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ssh3Q8K330 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ssh3Q8K330 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ssh3Q8K330 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ssh3Q8K330 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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