Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y7

Mrpl47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl47Q8K2Y7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl47Q8K2Y7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl47Q8K2Y7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl47Q8K2Y7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl47Q8K2Y7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl47Q8K2Y7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl47Q8K2Y7 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl47Q8K2Y7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl47Q8K2Y7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl47Q8K2Y7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl47Q8K2Y7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl47Q8K2Y7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl47Q8K2Y7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl47Q8K2Y7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl47Q8K2Y7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl47Q8K2Y7 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl47Q8K2Y7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl47Q8K2Y7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl47Q8K2Y7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl47Q8K2Y7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl47Q8K2Y7 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl47Q8K2Y7 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl47Q8K2Y7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl47Q8K2Y7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl47Q8K2Y7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl47Q8K2Y7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl47Q8K2Y7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms