Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms