Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms