Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LgsnQ8CIX8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms