Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc43a2Q8CGA3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc43a2Q8CGA3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc43a2Q8CGA3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc43a2Q8CGA3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc43a2Q8CGA3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc43a2Q8CGA3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc43a2Q8CGA3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc43a2Q8CGA3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc43a2Q8CGA3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc43a2Q8CGA3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc43a2Q8CGA3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc43a2Q8CGA3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc43a2Q8CGA3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc43a2Q8CGA3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc43a2Q8CGA3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc43a2Q8CGA3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc43a2Q8CGA3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc43a2Q8CGA3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc43a2Q8CGA3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc43a2Q8CGA3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc43a2Q8CGA3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc43a2Q8CGA3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc43a2Q8CGA3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc43a2Q8CGA3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc43a2Q8CGA3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc43a2Q8CGA3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc43a2Q8CGA3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc43a2Q8CGA3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc43a2Q8CGA3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc43a2Q8CGA3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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