Protein–RNA interactions for Protein: Q8CG50

Rab43, Ras-related protein Rab-43, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab43Q8CG50 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Rab43Q8CG50 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rab43Q8CG50 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rab43Q8CG50 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rab43Q8CG50 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rab43Q8CG50 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rab43Q8CG50 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rab43Q8CG50 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rab43Q8CG50 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rab43Q8CG50 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rab43Q8CG50 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rab43Q8CG50 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rab43Q8CG50 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab43Q8CG50 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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