Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI7

Polr2b, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2bQ8CFI7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2bQ8CFI7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Polr2bQ8CFI7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Polr2bQ8CFI7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Polr2bQ8CFI7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Polr2bQ8CFI7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Polr2bQ8CFI7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2bQ8CFI7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2bQ8CFI7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2bQ8CFI7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2bQ8CFI7 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2bQ8CFI7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2bQ8CFI7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2bQ8CFI7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2bQ8CFI7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2bQ8CFI7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2bQ8CFI7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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