Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh13Q8CEE7 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms