Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
9030612E09RikQ8CE20 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms