Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc9Q8CDN9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc9Q8CDN9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc9Q8CDN9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc9Q8CDN9 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc9Q8CDN9 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc9Q8CDN9 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc9Q8CDN9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc9Q8CDN9 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc9Q8CDN9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc9Q8CDN9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc9Q8CDN9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc9Q8CDN9 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc9Q8CDN9 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc9Q8CDN9 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc9Q8CDN9 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc9Q8CDN9 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc9Q8CDN9 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Lrrc9Q8CDN9 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc9Q8CDN9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc9Q8CDN9 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc9Q8CDN9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Lrrc9Q8CDN9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Lrrc9Q8CDN9 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc9Q8CDN9 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc9Q8CDN9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc9Q8CDN9 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc9Q8CDN9 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc9Q8CDN9 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc9Q8CDN9 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc9Q8CDN9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc9Q8CDN9 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc9Q8CDN9 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc9Q8CDN9 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc9Q8CDN9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc9Q8CDN9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc9Q8CDN9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc9Q8CDN9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc9Q8CDN9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc9Q8CDN9 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc9Q8CDN9 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Lrrc9Q8CDN9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Lrrc9Q8CDN9 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc9Q8CDN9 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc9Q8CDN9 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc9Q8CDN9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc9Q8CDN9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Lrrc9Q8CDN9 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc9Q8CDN9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc9Q8CDN9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc9Q8CDN9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc9Q8CDN9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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Lrrc9Q8CDN9 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrrc9Q8CDN9 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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Lrrc9Q8CDN9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrrc9Q8CDN9 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrrc9Q8CDN9 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrrc9Q8CDN9 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrrc9Q8CDN9 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrrc9Q8CDN9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
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Lrrc9Q8CDN9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc9Q8CDN9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc9Q8CDN9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Lrrc9Q8CDN9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc9Q8CDN9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc9Q8CDN9 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc9Q8CDN9 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc9Q8CDN9 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc9Q8CDN9 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Lrrc9Q8CDN9 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc9Q8CDN9 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc9Q8CDN9 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc9Q8CDN9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc9Q8CDN9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms