Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ephb1Q8CBF3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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