Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx16Q8C080 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms