Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Usp38Q8BW70 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Usp38Q8BW70 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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