Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms