Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms